更正処分された場合の不利益

更正か、修正申告かの選択

税務調査で税務署から指摘され、納める税額が過少となった場合には、
納税者が自ら修正申告書を提出するか、税務署等に更正処分してもらうかのいずれかになります。

この選択をする際のポイントは、その後「不服申立て」をするかどうかにあります。

「不服申立て」とは、税務署長の行った更正処分に納得がいかない場合に、
税務署長に対して異議を申立てることですが、
修正申告書を一度でも提出した場合には、不服申立てをすることが出来なくなってしまいます。

したがって、不服申立てをするつもりが全くないのであれば、
今後の税務署との関係や長引いた場合の延滞税等の増加額を考慮して
速やかに修正申告書を提出した方が良いのです。

今回の指摘事項についての内容が詳しくわかりませんので一概には言えませんが
相談者様において、その指摘が絶対に納得できないものなのであれば
安易に泣き寝入りし修正申告をしてしまえば二度と不服申し立てはできなくなってしまいます。

もう一度御社の税理士の方と、なぜ否認を受け入れるべきなのかお話しすることが
まずもって必要かと思います。